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1、該方式國內(nèi)只是剛起步，工程項目可參照物較少，須有摸索、積累的過程。

2、企業(yè)內(nèi)部尚未建立起一套完善的數(shù)據(jù)庫及公司的價格標準，而該項工作是相當龐大繁瑣的。

3、現(xiàn)有承包方能力不足，很難按工程量清單完成相關(guān)報價。

4、在投標過程中，容易發(fā)生投標方互相竄標的情況，或通過在投標總價不變的情況下，提高分項單價，降低工程量，待工程變更出現(xiàn)后，給業(yè)主帶來損失。

5、工程量清單在項目招投標評標階段耗時較長，前期準備工作極復(fù)雜，對于開發(fā)周期短的工程項目，較難實施。

6、現(xiàn)階段因設(shè)計單位在設(shè)計中大多重技術(shù)輕經(jīng)濟，設(shè)計人員似乎只對設(shè)計工程的質(zhì)量負責，對工程造價的高低不太關(guān)心。以致無法通過優(yōu)化設(shè)計方案，編制初步設(shè)計、概算起到控制總造價的作用。對于業(yè)主來說需花費更多的精力在此項工作。